L'action se déroule en 2161, au coeur d'une guerre entre soldats cybernétiques et combattants génétiquement modifiés. Le joueur peut altérer le relief dans les différents niveaux aux environnements destructibles grâce à l'armement futuriste dont il dispose. Il peut ainsi ouvrir de nouveaux passages et accéder à des zones surélevées. Fracture propose également un mode multijoueur capable d'accueillir 12 combattants en même temps.